به گزارش خبرنگار مهر، داستان این انیمیشن درباره نهنگی کوچک است که با پدر و مادرش زندگی می‌کند. تا اینکه یک روز در پی حمله شکارچیان پدر و مادرش را از دست می‌دهد و در دریا سرگردان می‌شود.
در ادامه نهنگ با شنیدن صدای غیبی مأمور می‌شود که یونس پیامبر را ببلعد. یونس در شکم نهنگ توبه کرده و خدا را عبادت می‌کند و نهنگ مأموریت می‌یابد تا او را به ساحل نجات برساند.
نویسنده، تهیه کننده و کارگردان، تدوین و افکت و انتخاب موزیک این انیمیشن را مصطفی کریم‌زاده به عهده دارد.
دیگر عوامل انیمیشن "نهنگ یونس" عبارتند از استوری بورد: حسین خوشنود، انیماتور: مهدی اسکندری، طراح: مهدیه بختیاری، نسرین رحیمی و رویا عالیوند.