امیر قلعه نویی در گفتگو با خبرنگار مهر، در خصوص انتخاب اعضای هیات مدیره پرسپولیس و انتخاب نشدن هیات مدیره باشگاه استقلال توسط وزارت ورزش، ضمن بیان مطلب فوق اظهار کرد: طبیعتا انتخاب اعضای هیات مدیره دیر شده است. یک مربی باید در فصل نقل و انتقالات 12 امتیاز بگیرد یعنی هم خوب یار بگیرد و هم تمریناتش را خوب شروع کند.
وی ادامه داد: با این وضعیت فرصت از استقلال گرفته می‌شود. البته وزارت ورزش هم دنبال این است تا یک کار با برنامه و با مطالعه انجام دهد.
امیر رضا خادم معاون پارلمانی و حقوقی وزارت ورزش هفته گذشته تاکید کرده بود حرمت علی دایی و امیر قلعه‌نویی در پرسپولیس و استقلال باید حفظ شود. سرمربی استقلال درباره اینکه آیا با خادم بعد از این اظهار نظر، صحبتی برای ماندن در استقلال داشته است یا خیر، گفت: خیر، بنده صحبتی با آقای خادم انجام نداده‌ام.
قلعه‌نویی در پایان در پاسخ به این سئوال که "آیا از ترکیب جدید اعضای هیات مدیره استقلال با خبر است یا خیر"؟ گفت: خیر، بنده خبری در این‌باره ندارم.